MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae Hungary19A-6

Total Repeats: 37129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010380	GAAA	2	8	199	206	75 %	0 %	25 %	0 %	169832473
2	NC_010380	AAGA	2	8	240	247	75 %	0 %	25 %	0 %	169832473
3	NC_010380	TCA	2	6	291	296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169832473
4	NC_010380	GAAATG	2	12	338	349	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	169832473
5	NC_010380	AAC	2	6	360	365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169832473
6	NC_010380	ATT	2	6	374	379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169832473
7	NC_010380	GTA	2	6	380	385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169832473
8	NC_010380	GAA	2	6	467	472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169832473
9	NC_010380	AAAAG	2	10	541	550	80 %	0 %	20 %	0 %	169832473
10	NC_010380	GGA	2	6	659	664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169832473
11	NC_010380	TTA	2	6	686	691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169832473
12	NC_010380	GAAAT	2	10	702	711	60 %	20 %	20 %	0 %	169832473
13	NC_010380	A	6	6	715	720	100 %	0 %	0 %	0 %	169832473
14	NC_010380	AT	3	6	742	747	50 %	50 %	0 %	0 %	169832473
15	NC_010380	TTA	2	6	762	767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169832473
16	NC_010380	GAT	2	6	848	853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169832473
17	NC_010380	A	7	7	871	877	100 %	0 %	0 %	0 %	169832473
18	NC_010380	GAA	2	6	890	895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169832473
19	NC_010380	GAG	2	6	983	988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169832473
20	NC_010380	A	8	8	1195	1202	100 %	0 %	0 %	0 %	169832473
21	NC_010380	TGC	2	6	1225	1230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169832473
22	NC_010380	ATA	2	6	1413	1418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169832473
23	NC_010380	GGAA	2	8	1434	1441	50 %	0 %	50 %	0 %	169832473
24	NC_010380	TCAT	2	8	1467	1474	25 %	50 %	0 %	25 %	169832473
25	NC_010380	AAAAT	2	10	1484	1493	80 %	20 %	0 %	0 %	169832473
26	NC_010380	TGAT	2	8	1497	1504	25 %	50 %	25 %	0 %	169832473
27	NC_010380	AATC	2	8	1533	1540	50 %	25 %	0 %	25 %	169832473
28	NC_010380	AAT	2	6	1554	1559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169832473
29	NC_010380	TAA	2	6	1734	1739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834446
30	NC_010380	ATTT	2	8	1742	1749	25 %	75 %	0 %	0 %	169834446
31	NC_010380	TAC	2	6	1764	1769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834446
32	NC_010380	AG	3	6	1772	1777	50 %	0 %	50 %	0 %	169834446
33	NC_010380	A	7	7	1895	1901	100 %	0 %	0 %	0 %	169834446
34	NC_010380	CTT	2	6	1925	1930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834446
35	NC_010380	CTT	2	6	1942	1947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834446
36	NC_010380	CTT	2	6	1952	1957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834446
37	NC_010380	GTA	2	6	1969	1974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834446
38	NC_010380	AGCA	2	8	2106	2113	50 %	0 %	25 %	25 %	169834446
39	NC_010380	ATT	2	6	2149	2154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834446
40	NC_010380	TGC	2	6	2169	2174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169834446
41	NC_010380	AG	3	6	2184	2189	50 %	0 %	50 %	0 %	169834446
42	NC_010380	A	6	6	2278	2283	100 %	0 %	0 %	0 %	169834446
43	NC_010380	A	7	7	2294	2300	100 %	0 %	0 %	0 %	169834446
44	NC_010380	TGA	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834446
45	NC_010380	GAT	2	6	2365	2370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834446
46	NC_010380	ACT	2	6	2500	2505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834446
47	NC_010380	GTT	2	6	2608	2613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169834446
48	NC_010380	GTAAA	2	10	2642	2651	60 %	20 %	20 %	0 %	169834446
49	NC_010380	GAA	2	6	2653	2658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834446
50	NC_010380	ACTT	2	8	2710	2717	25 %	50 %	0 %	25 %	169834446
51	NC_010380	GATT	2	8	2718	2725	25 %	50 %	25 %	0 %	169834446
52	NC_010380	CAG	2	6	2798	2803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169834446
53	NC_010380	TTG	2	6	2937	2942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169832865
54	NC_010380	A	6	6	2948	2953	100 %	0 %	0 %	0 %	169832865
55	NC_010380	AAAAT	2	10	3029	3038	80 %	20 %	0 %	0 %	169832865
56	NC_010380	TGT	2	6	3055	3060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169832865
57	NC_010380	ATG	2	6	3062	3067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169832865
58	NC_010380	ATT	2	6	3101	3106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169832865
59	NC_010380	CAG	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169834529
60	NC_010380	GCA	2	6	3280	3285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169834529
61	NC_010380	CGA	2	6	3299	3304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169834529
62	NC_010380	TGG	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169834529
63	NC_010380	AACT	2	8	3353	3360	50 %	25 %	0 %	25 %	169834529
64	NC_010380	TGA	3	9	3516	3524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834529
65	NC_010380	AATT	2	8	3599	3606	50 %	50 %	0 %	0 %	169834529
66	NC_010380	TTC	2	6	3701	3706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834529
67	NC_010380	AGA	2	6	3726	3731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834529
68	NC_010380	GAC	2	6	3801	3806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169834529
69	NC_010380	CAAA	2	8	3876	3883	75 %	0 %	0 %	25 %	169834529
70	NC_010380	AGT	2	6	3915	3920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834529
71	NC_010380	GAA	2	6	3943	3948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834529
72	NC_010380	GAT	2	6	3961	3966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834529
73	NC_010380	A	6	6	3973	3978	100 %	0 %	0 %	0 %	169834529
74	NC_010380	CTTG	2	8	4044	4051	0 %	50 %	25 %	25 %	169834529
75	NC_010380	ACTT	2	8	4060	4067	25 %	50 %	0 %	25 %	169834529
76	NC_010380	AAG	2	6	4082	4087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834529
77	NC_010380	CTC	2	6	4121	4126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169834529
78	NC_010380	AGC	2	6	4128	4133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169834529
79	NC_010380	TAT	2	6	4137	4142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834529
80	NC_010380	AAG	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834529
81	NC_010380	GAA	2	6	4249	4254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834529
82	NC_010380	AT	3	6	4263	4268	50 %	50 %	0 %	0 %	169834529
83	NC_010380	AAAT	2	8	4376	4383	75 %	25 %	0 %	0 %	169833645
84	NC_010380	AAACA	2	10	4431	4440	80 %	0 %	0 %	20 %	169833645
85	NC_010380	TTGA	2	8	4457	4464	25 %	50 %	25 %	0 %	169833645
86	NC_010380	GAA	2	6	4474	4479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169833645
87	NC_010380	AC	3	6	4496	4501	50 %	0 %	0 %	50 %	169833645
88	NC_010380	A	6	6	4548	4553	100 %	0 %	0 %	0 %	169833645
89	NC_010380	ATGA	2	8	4580	4587	50 %	25 %	25 %	0 %	169833645
90	NC_010380	TTA	2	6	4610	4615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169833645
91	NC_010380	GAT	2	6	4658	4663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833645
92	NC_010380	CAG	2	6	4707	4712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169833645
93	NC_010380	TAT	2	6	4735	4740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169833645
94	NC_010380	ATTGGA	2	12	4778	4789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833645
95	NC_010380	GTT	2	6	4811	4816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169833645
96	NC_010380	CAT	2	6	4817	4822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169833645
97	NC_010380	GAT	2	6	4844	4849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833645
98	NC_010380	ACT	2	6	4896	4901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169833645
99	NC_010380	TTA	2	6	4961	4966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169833013
100	NC_010380	A	6	6	4994	4999	100 %	0 %	0 %	0 %	169833013
101	NC_010380	CTA	2	6	5055	5060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169833013
102	NC_010380	TTGCAA	2	12	5067	5078	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	169833013
103	NC_010380	AGA	2	6	5092	5097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169833013
104	NC_010380	GAT	2	6	5198	5203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833013
105	NC_010380	TGG	2	6	5211	5216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169833013
106	NC_010380	A	6	6	5238	5243	100 %	0 %	0 %	0 %	169833013
107	NC_010380	T	6	6	5269	5274	0 %	100 %	0 %	0 %	169833013
108	NC_010380	GCA	2	6	5315	5320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169833013
109	NC_010380	GATT	2	8	5325	5332	25 %	50 %	25 %	0 %	169833013
110	NC_010380	GAA	2	6	5384	5389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169833013
111	NC_010380	GAG	2	6	5478	5483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169833013
112	NC_010380	T	6	6	5534	5539	0 %	100 %	0 %	0 %	169833013
113	NC_010380	TGA	2	6	5542	5547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833013
114	NC_010380	GAAA	2	8	5590	5597	75 %	0 %	25 %	0 %	169833013
115	NC_010380	GA	3	6	5641	5646	50 %	0 %	50 %	0 %	169833013
116	NC_010380	AGA	2	6	5725	5730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169833013
117	NC_010380	TGA	2	6	5851	5856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833013
118	NC_010380	TGA	2	6	5868	5873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833013
119	NC_010380	AGA	2	6	5917	5922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169833013
120	NC_010380	A	6	6	5984	5989	100 %	0 %	0 %	0 %	169833013
121	NC_010380	TCAAT	2	10	6058	6067	40 %	40 %	0 %	20 %	169833013
122	NC_010380	TTTTC	2	10	6098	6107	0 %	80 %	0 %	20 %	169833013
123	NC_010380	AGA	2	6	6112	6117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169833013
124	NC_010380	A	7	7	6131	6137	100 %	0 %	0 %	0 %	169833013
125	NC_010380	ATT	2	6	6149	6154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169833013
126	NC_010380	GGA	2	6	6190	6195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169833013
127	NC_010380	CGT	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169833013
128	NC_010380	ACA	2	6	6373	6378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169833013
129	NC_010380	AG	3	6	6391	6396	50 %	0 %	50 %	0 %	169833013
130	NC_010380	TGT	2	6	6433	6438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169833013
131	NC_010380	CAT	2	6	6440	6445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169833013
132	NC_010380	AT	3	6	6580	6585	50 %	50 %	0 %	0 %	169833013
133	NC_010380	TAAAT	2	10	6616	6625	60 %	40 %	0 %	0 %	169833013
134	NC_010380	TGA	2	6	6682	6687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833013
135	NC_010380	ACTCT	2	10	6697	6706	20 %	40 %	0 %	40 %	169833013
136	NC_010380	TGA	4	12	6742	6753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833013
137	NC_010380	TGA	2	6	6766	6771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833013
138	NC_010380	GAT	2	6	6794	6799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833013
139	NC_010380	GTA	2	6	6807	6812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833013
140	NC_010380	CGA	2	6	6957	6962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169833013
141	NC_010380	A	6	6	7052	7057	100 %	0 %	0 %	0 %	169833013
142	NC_010380	TGT	2	6	7138	7143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169833013
143	NC_010380	TGA	2	6	7161	7166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833013
144	NC_010380	TGA	2	6	7171	7176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833013
145	NC_010380	GAA	2	6	7222	7227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169833013
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150	NC_010380	TTTA	2	8	7633	7640	25 %	75 %	0 %	0 %	169833013
151	NC_010380	GTCG	2	8	7694	7701	0 %	25 %	50 %	25 %	169833013
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154	NC_010380	TTA	2	6	7919	7924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169833013
155	NC_010380	AAACG	2	10	7940	7949	60 %	0 %	20 %	20 %	169833013
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158	NC_010380	TTGGT	2	10	8169	8178	0 %	60 %	40 %	0 %	169833013
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162	NC_010380	ATT	2	6	8283	8288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169833013
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172	NC_010380	CGT	2	6	8832	8837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169833356
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176	NC_010380	TGA	2	6	9008	9013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833356
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268	NC_010380	GTA	2	6	12881	12886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833372
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272	NC_010380	GTT	2	6	12973	12978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169833372
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275	NC_010380	CT	3	6	13176	13181	0 %	50 %	0 %	50 %	169833372
276	NC_010380	A	6	6	13195	13200	100 %	0 %	0 %	0 %	169833372
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